Nii uskumatu, kui see ka ei ole, on naerukoolitusel tõepoolest ka vastunäidustusi. Mõned inimesed peaksid enne naeruteraapiaseanssi pidama arstiga nõu. Naeruteraapias peaksid olema ettevaatlikud need, kes on käinud hiljuti operatsioonil, kellel on südameprobleemid, song või kes on varajases rasedusstaadiumis.
Naeruharjutused ei sobi ka neile, kes on tarvitanud liialt alkoholi või manustavad antidepressante.